MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus mutans GS-5 chromosome

Total Repeats: 8151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018089	TTTTGT	2	12	1	12	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018089	ATC	2	6	70	75	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018089	T	6	6	122	127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018089	TTA	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018089	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018089	TGA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018089	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018089	ACT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018089	TTA	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018089	TAT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018089	GTT	2	6	2864	2869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018089	T	6	6	2868	2873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018089	A	7	7	2945	2951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018089	ATTA	2	8	2956	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018089	GCT	2	6	3076	3081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018089	TAT	2	6	3375	3380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018089	A	6	6	4608	4613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018089	CTT	2	6	4636	4641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018089	GGAAA	2	10	4662	4671	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018089	TTA	2	6	8738	8743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018089	TGT	2	6	8785	8790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018089	ATAAA	2	10	8831	8840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018089	TAAT	2	8	12689	12696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018089	ACCA	2	8	14685	14692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018089	GGAATA	2	12	14702	14713	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018089	TTA	2	6	14744	14749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018089	CATT	2	8	14765	14772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018089	TAAC	2	8	14781	14788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018089	ATA	2	6	14792	14797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018089	TGT	2	6	14845	14850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018089	T	6	6	14903	14908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018089	TTAA	2	8	14929	14936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018089	TTCA	2	8	14979	14986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018089	TCGC	2	8	14996	15003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018089	AAT	2	6	15020	15025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018089	A	6	6	15044	15049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018089	T	6	6	15082	15087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018089	TAA	2	6	15127	15132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018089	TAA	2	6	15139	15144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018089	TAT	2	6	16622	16627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018089	A	7	7	16686	16692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018089	G	6	6	16714	16719	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018089	AAG	2	6	16736	16741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018089	AAG	2	6	16780	16785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018089	AACC	2	8	16789	16796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018089	GGC	2	6	16923	16928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018089	AC	3	6	16961	16966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018089	ATA	2	6	17071	17076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018089	ATT	2	6	17080	17085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018089	ATTG	2	8	17094	17101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018089	TAG	2	6	17121	17126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018089	GGTAA	2	10	17153	17162	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018089	CGA	2	6	17176	17181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018089	GCA	2	6	17250	17255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018089	CGC	2	6	17297	17302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018089	GTGA	2	8	17303	17310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018089	TGT	2	6	17336	17341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018089	GT	3	6	17353	17358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018089	CA	3	6	17373	17378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018089	CAG	2	6	17419	17424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018089	AT	3	6	17603	17608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018089	GGA	2	6	17609	17614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018089	CT	3	6	17634	17639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018089	GAA	2	6	17873	17878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018089	GGT	2	6	17947	17952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018089	GTC	2	6	17961	17966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018089	TCGTG	2	10	17970	17979	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018089	CAT	2	6	18029	18034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018089	TAA	2	6	18064	18069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018089	GGA	2	6	18073	18078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018089	ATC	2	6	18097	18102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018089	AC	3	6	18124	18129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018089	CGC	2	6	18263	18268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018089	AC	3	6	18293	18298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018089	CAC	2	6	18308	18313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018089	GCC	2	6	18361	18366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018089	GATG	2	8	18375	18382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018089	CCT	2	6	18435	18440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018089	CTT	2	6	18474	18479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018089	AGG	2	6	18542	18547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018089	AGA	2	6	18620	18625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018089	AAG	2	6	18640	18645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018089	A	6	6	18786	18791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018089	GTTAA	2	10	18832	18841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018089	ACGA	2	8	18891	18898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018089	GTAA	2	8	18918	18925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018089	GAAG	2	8	19000	19007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018089	GCG	2	6	19071	19076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018089	AGG	2	6	19088	19093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018089	AGC	2	6	19138	19143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018089	AGA	3	9	19153	19161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018089	AG	4	8	19179	19186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018089	CGG	2	6	19237	19242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018089	AAG	2	6	19389	19394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018089	TTACGT	2	12	19447	19458	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018089	GGA	2	6	19587	19592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018089	TC	3	6	19673	19678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018089	GTCG	2	8	19700	19707	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018089	TTGA	2	8	19734	19741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018089	ACC	2	6	19852	19857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_018089	AAT	2	6	19872	19877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018089	AGC	2	6	19932	19937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018089	ATTC	2	8	19939	19946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018089	GA	3	6	20210	20215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018089	AGG	2	6	20274	20279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018089	GCA	2	6	20283	20288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018089	GTGAG	2	10	20329	20338	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018089	CCA	2	6	20365	20370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018089	TAG	2	6	20393	20398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018089	GAGC	2	8	20502	20509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018089	CT	3	6	20622	20627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018089	CGG	2	6	20733	20738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018089	GA	3	6	20831	20836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018089	TAGG	2	8	20949	20956	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018089	TAC	2	6	21003	21008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018089	TG	3	6	21012	21017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018089	ATC	2	6	21043	21048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018089	CCT	2	6	21091	21096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018089	GACA	2	8	21184	21191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018089	GGT	2	6	21227	21232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018089	TCG	2	6	21342	21347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018089	CGT	2	6	21422	21427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018089	GTT	2	6	21525	21530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018089	AGGG	2	8	21560	21567	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018089	C	6	6	21598	21603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_018089	GA	3	6	21646	21651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018089	T	6	6	21812	21817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018089	T	6	6	21841	21846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018089	AAAG	2	8	21847	21854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018089	GCTA	2	8	21878	21885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018089	GTGA	2	8	21893	21900	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018089	TGA	2	6	21919	21924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018089	CAG	2	6	21960	21965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018089	AGT	2	6	21986	21991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018089	GTC	2	6	22017	22022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018089	TTAG	2	8	22127	22134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018089	GTG	2	6	22142	22147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018089	AG	3	6	22222	22227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018089	ATC	2	6	22230	22235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018089	TCA	2	6	22306	22311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018089	CGT	2	6	22550	22555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018089	AGG	2	6	22563	22568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018089	ATAA	2	8	22653	22660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018089	ATG	2	6	22774	22779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018089	ATT	2	6	22866	22871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018089	CGC	2	6	22938	22943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_018089	ATTA	2	8	22949	22956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018089	GGA	2	6	23057	23062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018089	GCGT	2	8	23116	23123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018089	TCC	2	6	23140	23145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_018089	TCG	2	6	23183	23188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_018089	CGG	2	6	23289	23294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_018089	TGT	2	6	23360	23365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_018089	GATGA	2	10	23655	23664	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_018089	T	7	7	23731	23737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018089	TTA	2	6	23754	23759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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